Intercambio de datos del genoma para abordar futuros potenciales pandémicos

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Todas las investigaciones de Indonesia pueden descargar los datos de forma gratuita con solo citar las fuentes.

Cuando se confirmó el primer paciente con COVID-19 en Indonesia en marzo de 2020, los expertos utilizaron varios términos relacionados con la salud, como secuenciación del genoma, mientras discutían el asunto.

El público en general se familiarizó más con el término secuenciación del genoma tras la aparición de las variantes de COVID-19, que comprenden Delta y Omicron y sus subvariantes, como BA.2.

La secuenciación del genoma se lleva a cabo para saber si se produce una mutación en el virus SARS-CoV-2.

Se puede realizar la secuenciación del genoma completo (WGS) para determinar la secuencia de ácido nucleico de un genoma. Debido a la importancia de WGS, el Ministerio de Salud recientemente comenzó a distribuir su máquina a varios laboratorios en Indonesia.

En el manejo de COVID-19, la secuenciación del genoma produce los datos del genoma del virus SARS-CoV-2 para obtener las características del virus.

Estos datos también son beneficiosos para el desarrollo de medicamentos y vacunas en el manejo global de la pandemia de COVID-19.

La importancia de los datos del genoma en el sector de la salud también se convirtió en uno de los factores que impulsaron a Indonesia a fomentar el fortalecimiento de la plataforma mundial de intercambio de datos de secuencias del genoma durante la presidencia del G20.

El G20 es un foro internacional compuesto por 19 naciones que trabajan juntas para manejar varios problemas importantes, con Indonesia presidiendo el foro de este año.

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Esta medida de fortalecimiento fue uno de los temas en discusión relacionados con la reforma de la arquitectura mundial de la salud.

El ministro de Salud, Budi Gunadi Sadikin, destacó la importancia de que la plataforma de intercambio de datos de secuencia sea accesible para todas las partes debido al hecho de que es necesaria una respuesta rápida para manejar la pandemia.

Es necesario mejorar la capacidad para manejar posibles pandemias en el futuro para prevenir, detectar y responder de manera efectiva y rápida a varios problemas existentes.

Sadikin señaló que la importancia de fortalecer la plataforma de intercambio de datos de secuencias del genoma, entre otros, se basa en la experiencia cuando surgió el COVID-19 en Wuhan, China.

Investigadores de todo el mundo pueden acceder a los datos de la secuenciación del genoma cargados durante el período, lo que contribuye al desarrollo de vacunas contra el COVID-19.

La secuencia del genoma del SARS-CoV-2 permite a los investigadores de todo el mundo analizar más a fondo el virus y conocer en detalle cómo el virus puede causar una enfermedad.

En uno de los eventos del G20 en febrero, Sadikin señaló que la plataforma de intercambio de datos debería estar libre de intereses geopolíticos y económicos y, en cambio, centrarse en el objetivo humanitario de salvar vidas mientras se enfrenta al potencial pandémico en el futuro.

Anteriormente, la iniciativa mundial sobre el acceso abierto a los datos del genoma del virus de la influenza se había realizado en forma de la Iniciativa mundial para compartir datos sobre la influenza aviar (GISAID) en 2008.

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Este paso se tomó en respuesta a la propagación del virus H5N1 que causa la influenza aviar.

Al comienzo de la formación de GISAID, Indonesia apoyó la existencia de la plataforma que tiene como objetivo facilitar el intercambio de datos sobre la influenza aviar.

La plataforma GISAID puede ser utilizada por cualquier persona siempre que confirme su identidad y cumpla con el acuerdo de acceso a la base de datos.

Esto se hace para evitar que los usuarios compartan los datos con otras partes que no estén de acuerdo con las condiciones para utilizar los datos de GISAID.

Actualmente, GISAID tiene la mayor colección de datos de secuencias de SARS-CoV-2 en el mundo, a partir de los datos completos del genoma del virus en 2020.

Hasta mediados de abril de 2021, hubo 1,2 millones de envíos de datos relacionados con el virus de cientos de países.

En abril de 2022, se habían acumulado más de 10 millones de datos relacionados con la secuencia del genoma del virus.

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Compartir datos

La importancia del intercambio de datos también fue compartida por el virólogo I Gusti Ngurah Kade Mahardika, quien señaló que Indonesia se beneficia enormemente del intercambio de datos de secuencias del genoma.

Los investigadores indonesios no solo pueden obtener los productos de la investigación realizada en base a la secuencia del genoma compartido, sino también acceder a la diversidad de datos del genoma.

«Todas las investigaciones de Indonesia pueden descargar los datos de forma gratuita con solo citar las fuentes», explicó Mahardika.

En particular, presionó para una mayor participación de Indonesia en la plataforma de intercambio de datos del genoma, ya que la contribución de Indonesia en el intercambio de datos no ha sido óptima.

De los 10 millones de datos de secuencias de SARS-CoV-2 que existen, Indonesia aporta solo entre 10 mil y 20 mil. Esta contribución subóptima también se aplica a otras categorías, comentó.

Con este fin, destacó la importancia de reforzar el papel de Indonesia en el intercambio de datos de secuencias genómicas.

Esto se puede lograr cambiando la mentalidad de la nación e internalizando la importancia de compartir datos para abrir el acceso a otros investigadores globales.

Sin embargo, el desarrollo y la creación de diversos datos de secuencias genómicas requiere una gran financiación. Esto es problemático ya que varios investigadores indonesios reciben fondos de investigación inadecuados.

«No habrá muchos que puedan producir tales datos», comentó.

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También subrayó la importancia de la ética, para que los resultados de los datos de la secuencia del genoma individual puedan cargarse en una base de datos internacional.

La contribución de datos de Indonesia a la base de datos internacional aún no es óptima, ya que no es obligatorio que las revistas de Indonesia se carguen en la base de datos internacional.

Sobre la base de los beneficios que se pueden obtener a través de la práctica de intercambio de datos de secuencias del genoma, se puede ver la importancia de fortalecer la plataforma de intercambio de datos, que Indonesia busca fomentar.

Esto se hace en aras de decisiones y respuestas rápidas para salvar vidas en medio de posibles pandemias en el futuro.

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