Los científicos proponen un nuevo enfoque para analizar las secuencias genéticas del coronavirus SARS-CoV-2 | Astronomía

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Investigadores de la Organización de Investigación Científica e Industrial de la Commonwealth (CSIRO) han desarrollado una nueva plataforma de visualización, respaldada por algoritmos bioinformáticos utilizados originalmente para analizar el genoma humano, para identificar las diferencias entre las miles de secuencias genéticas del SARS-CoV-2, un nuevo coronavirus. que causa la enfermedad COVID-19.

La estructura de un coronavirus. Crédito de imagen: Scientificanimations.com / CC BY-SA 4.0.

“Cuanto más sepamos sobre este virus, mejor armados estaremos para combatirlo”, dijo el Dr. Larry Marshall, Director Ejecutivo de CSIRO.

“Este análisis altamente complejo de la secuencia del genoma del virus SARS-CoV-2 ya ha ayudado a determinar qué cepas del virus son adecuadas para probar las vacunas en curso en el Centro Australiano para la Preparación de Enfermedades en Geelong, la única instalación de alto nivel de biocontención de su amable en el hemisferio sur “.

“A medida que el virus evolucionó, el genoma se vuelve cada vez más importante, efectivamente porque contiene instrucciones sobre el comportamiento del virus y qué tipo de enfermedad puede causar”, dijo el Dr. Denis Bauer, líder del equipo de bioinformática de CSIRO e investigador de la Universidad Macquarie.

“A nivel mundial, ahora hay una gran cantidad de secuencias de virus individuales. Evaluar la distancia evolutiva entre estos puntos de datos y visualizarlos ayuda a los investigadores a conocer las diferentes cepas del virus, incluido de dónde provienen y cómo continúan evolucionando “.

Comprender las secuencias del genoma ayuda a los investigadores a elegir la cepa correcta del virus SARS-CoV-2 para los esfuerzos de vacuna y diagnóstico. Crédito de la imagen: CSIRO.

Comprender las secuencias del genoma ayuda a los investigadores a elegir la cepa correcta del virus SARS-CoV-2 para la vacuna y los esfuerzos de diagnóstico. Crédito de la imagen: CSIRO.

Se analizaron los primeros 181 genomas publicados de SARS-CoV-2 para comprender cómo los cambios en el virus podrían afectar su comportamiento e impacto.

“Se espera que este virus ARN evolucione en una serie de grupos distintos que comparten mutaciones, que es lo que hemos confirmado y visualizado”, dijo el profesor S.S. Vasan, líder del equipo de patógenos peligrosos de CSIRO e investigador de la Universidad de York.

“En este momento, no esperamos que afecte el desarrollo y la evaluación de las vacunas, terapias y diagnósticos COVID-19, pero es información importante para monitorear a medida que avanzan los estudios preclínicos y clínicos”.

“Para permitir esto, pedimos a la comunidad internacional de investigación que comparta detalles no identificados de la gravedad del caso y los resultados, y otros metadatos relevantes, como las comorbilidades y el tabaquismo, junto con las secuencias genómicas del virus”.

Este estudio muestra la importancia de la colaboración cruzada entre las disciplinas establecidas y emergentes de bioinformática, genómica, vacunología y virología.

“Seguir el proceso científico de publicación abierta revisada por pares como este es un componente vital de la respuesta de CSIRO”, dijo el Dr. David Hansen, CEO del Centro de Investigación de Salud Electrónica de CSIRO en Australia.

El artículo del equipo fue publicado en la revista. Enfermedades transfronterizas y emergentes.

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Denis C. Bauer et al. Apoyo a la respuesta pandémica mediante genómica y bioinformática: un estudio de caso sobre el brote emergente de SARS-CoV-2. Enfermedades transfronterizas y emergentes, publicado en línea el 19 de abril de 2020; doi: 10.1111 / tbed.13588

Este artículo se basa en el texto proporcionado por CSIRO.

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