Las terapias dirigidas para los tumores del estroma gastrointestinal (GIST) a menudo fracasan debido a mutaciones de resistencia heterogéneas que surgen en diferentes sitios metastásicos. Para diseñar terapias específicas de manera eficiente y racional, es crucial poder cuantificar la resistencia al tratamiento en muchos genotipos en paralelo.
Investigadores han presentado BARcode MIXture analysis (BARMIX), una plataforma que combina experimentos multiplexados con mezclas de células cancerosas codificadas con ADN, tanto in vitro como in vivo, junto con un marco probabilístico para la evaluación cuantitativa de la resistencia al tratamiento específica del genotipo. BARMIX ha demostrado ser capaz de replicar con precisión patrones de resistencia clínica conocidos en GIST y ha concordado con las mediciones de resistencia obtenidas de líneas celulares individuales, tanto en el laboratorio como en modelos animales.
Este enfoque experimental-computacional ofrece una estrategia escalable y ampliamente aplicable para cuantificar las respuestas al tratamiento en poblaciones celulares complejas, permitiendo pruebas preclínicas sistemáticas de nuevos fármacos y combinaciones para identificar opciones terapéuticas específicas para la oncología de precisión en GIST y más allá.
Entre los investigadores involucrados se encuentran T.M. Y S.B., quienes son co-inventores de un nuevo tratamiento contra GIST, patentado por su institución. S.B. También recibe honorarios de Pharmamar, Dicephrea y Springworks, y tiene roles de consultoría o asesoramiento con Blueprint Medicines, Deciphera, Boehringer Ingelheim, IDRX, Adcendo y Merck, además de recibir financiación de IRDX y von Pfeffel Pharmaceuticals. El resto de los autores no declaran conflictos de intereses.
La investigación ha sido financiada por la Fundación Alemana de Investigación (DFG) con los identificadores 450917483 (GRK 2762 L1 y M1), HO 1582/12-1 y GR4575/1, así como por Cusanuswerk, que otorgó una beca de doctorado a P.D.
