Científicos del St. Jude Children’s Research Hospital, la Sociedad Americana de Hematología (ASH) y el Laboratorio de Leucemia de Múnich han desarrollado una plataforma de intercambio de datos que unifica información genómica, de expresión génica y clínica de casi 6,000 pacientes con cánceres de sangre.
El Programa ASH HematOmics (ASHOP), cuyos hallazgos iniciales fueron publicados hoy en la revista Blood, integra amplios conjuntos de datos tanto pediátricos como de adultos. Esta herramienta proporciona una de las colecciones de datos sobre cáncer de sangre más completas hasta la fecha, ofreciendo un recurso abierto con herramientas de análisis integradas para acelerar los descubrimientos en neoplasias hematológicas.
La plataforma incluye datos de 5,960 pacientes afectados por diversos tipos de cáncer de sangre, entre los que se encuentran la leucemia linfoblástica aguda, la leucemia mieloide aguda, los síndromes mielodisplásicos y la leucemia linfocítica crónica. El sistema combina en un solo lugar la secuenciación del genoma completo, la secuenciación del transcriptoma completo y los resultados clínicos conectados de estas muestras.
El Dr. Xin Zhou, del Departamento de Biología Computacional de St. Jude y coautor correspondiente senior, explicó que, aunque se habían generado grandes conjuntos de datos genómicos, transcriptómicos y clínicos en diversos estudios, estos se habían mantenido desconectados. Según Zhou, ASHOP reúne esta información en una plataforma accesible para que los investigadores puedan analizar las neoplasias hematológicas de manera más holística y profunda para realizar nuevos descubrimientos.
A través de la plataforma, los usuarios pueden aprovechar herramientas integradas para explorar tipos y subtipos de cáncer, comparar grupos de pacientes o investigar resultados clínicos conectados, lo que permite realizar análisis complejos que anteriormente no eran posibles.
