La rinosinusitis crónica (CRS) con pólipos nasales (CRSwNP) a menudo se presenta junto con la rinitis alérgica (RA). Sin embargo, la conexión subyacente entre estas dos afecciones aún no se comprende completamente. Un estudio reciente se propuso identificar y validar genes clave asociados a ambas condiciones, con el objetivo de proporcionar nuevas dianas y estrategias terapéuticas.
Los investigadores analizaron datos transcriptómicos relacionados con la RA y la CRSwNP. Los genes clave de comorbilidad se identificaron inicialmente a través del análisis de expresión diferencial en los conjuntos de datos GSE19190 y GSE136825, estudios de aleatorización mendeliana para la RA y la CRSwNP, y análisis de expresión génica en conjuntos de datos relacionados con la RA (GSE19190, GSE46171) y la CRSwNP (GSE136825, GSE179265). Posteriormente, se llevaron a cabo análisis de enriquecimiento funcional, infiltración inmune y predicción de fármacos basados en estos genes clave para explorar posibles dianas terapéuticas y los mecanismos detrás de la superposición entre la RA y la CRSwNP.
Para validar la expresión génica en muestras clínicas, se realizó una reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa de transcripción inversa. Además, se llevó a cabo un análisis de enriquecimiento del conjunto de genes de muestra única para la CRSwNP. El estudio identificó dos genes clave de comorbilidad, CD109 y CPA3, como críticos tanto para la RA como para la CRSwNP, con una expresión elevada en ambas condiciones. La reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa de transcripción inversa confirmó un aumento significativo en la expresión de CD109 en muestras de CRSwNP + RA (P = 0.01).
El análisis de enriquecimiento funcional reveló que los genes vinculados a la RA estaban asociados principalmente con el “asma” y el “linaje de células hematopoyéticas”, mientras que los genes relacionados con la CRSwNP se enriquecieron en “ciclo celular” y “rechazo de aloinjerto”. También se observaron diferencias significativas en la infiltración de células inmunitarias. En el grupo de RA, tanto CD109 como CPA3 mostraron la correlación positiva más fuerte con las células asesinas naturales (NK) CD56 brillantes. En el grupo de CRSwNP, CPA3 tuvo la correlación positiva más fuerte con las células B activadas, mientras que CD109 se correlacionó positivamente con las células T CD8 de memoria.
Las muestras de CRSwNP exhibieron puntuaciones más altas relacionadas con la piroptosis. Además, los análisis de predicción de fármacos identificaron 5 fármacos potenciales para CPA3 y 12 para CD109, presentando nuevas vías de tratamiento para ambas afecciones. CD109 y CPA3 fueron identificados como genes clave de comorbilidad en la RA y la CRSwNP, con su expresión validada en muestras clínicas. Los genes relacionados con la piroptosis también pueden desempeñar un papel importante en la CRSwNP.
Estos hallazgos proporcionan una base teórica para el desarrollo de terapias dirigidas para la RA y la CRSwNP.